(3)菌丝萎缩。发生原因：料袋堆垛太高，产生发酵热时未及时倒垛散热，料温升高达30℃以上烧坏菌丝；料袋大，装料多，发酵热多；发菌场地温度过高加之通风不良；料过湿且装得太实，透气不好，菌丝缺氧亦会出现菌丝萎缩现象。
　　解决办法：改善发菌场地环境，注意通风降温；料袋堆垛发菌，气温高时堆放2～4层，呈“井”字形交叉排放，或间隙排放便于散热；料袋发酵热产生期间及时倒垛散热；拌料时掌握好料水比，装袋时应松紧适宜。
　　(4)发菌后期吃料缓慢，迟迟长不满袋。发生原因：袋两头扎口过紧，袋内空气不足，造成缺氧。
　　解决办法：解绳松动料袋扎口或刺孔通气。
　　(5)软袋。一般在料表面长有菌丝，但袋内菌丝少，且稀疏不紧密，菌袋软而无弹性。发生原因：菌种退化或老化，生活力减弱；高温伤害了菌种；料的质量差，料内细菌大量繁殖，抑制菌丝生长；培养料含水量大，氧气不足，影响菌丝向料内生长。
　　解决办法：使用健壮优质菌种；适温接种，防高温伤菌；原料要新鲜，无霉、无结块，使用前在日光下暴晒2～3天；发生软袋时，降低发菌温度，袋壁刺孔，排湿透气，适当延长发菌时间，让菌丝往料内生长。
　　(6)袋壁布满豆渣样菌苔。发生原因：培养料含水量大，透气性差，引起酵母菌大量滋生，在袋膜上积聚，形成豆腐渣样菌苔，布满袋壁，料内出现发酵酸味，影响菌丝继续生长，此种情况尤以玉米芯为培养料时多见。
　　解决办法：用直径1厘米削尖的圆木棍在料袋两头往中间扎孔2～3个，深5～8厘米，以通气补氧。不久，袋内壁附着的酵母菌苔会逐渐自行消退，平菇菌丝就会继续生长。
　　(7)菌丝未满袋就出菇。发生原因：菇棚内光线过强或昼夜温差过大刺激出菇。
　　解决办法：注意遮光和夜间保温，改善发菌环境。
　　6.顺次排袋与开口催蕾
　　(1)顺次排袋。发菌阶段，在温度25℃左右，空气相对湿度60%左右、暗光和通风良好的条件下，一般经25～30天菌丝即可长满袋。当部分菌袋出现子实体原基时，表明菌丝体已经成熟，可适时转入出菇管理。菇棚消毒，按菌袋菌丝成熟早晚顺次整齐地垛放于畦床，垛高7～8层，正在发菌的袋可不排放。气温较高时，菌袋间亦应间隙排放，也可在层与层之间用细竹竿隔开以利散热。
　　(2)开口催蕾。开口的工具是用一根小木棍绑缚半片刮脸刀片。开口时，沿端面塑料袋边缘划两个半圆，形似正反双“C”。双“C”接头处不划开，仍保持相连。然后用手轻提袋口，使塑料膜与料面形成缝隙，进入新鲜空气。这样就形成既透气又保湿、利于菌丝扭结现蕾的小气候。小气候的湿度主要由菌丝呼出水分形成，因此，除非棚内土层过干不用格外加水增湿。
　　开口的次序依入棚顺序决定。一般每次开2～4垛，间隔至少5～7天，着意形成顺次开袋格局。这样，不仅能控制棚温和二氧化碳浓度的急剧上升，降低管理难度，还能使采菇不过于集中，减轻采菇压力。
　　7.出菇管理
　　子实体生长阶段分期管理的总原则：桑葚期促使原基多分化，珊瑚期保原基多存活，伸长期保柄盖按比例生长形成优质菇。具体方法：①桑葚期：温度控制在3℃～20℃，最适6℃～12℃，早晚无直射光或暗光时揭膜微通风，制造5℃～10℃温差进行刺激，湿度保持在80%～85%，这样经6～7天就有大量原基形成。②珊瑚期：菇蕾布满料面出现菌盖分化后可把双“C”塑料薄膜片逐渐提起撕掉。这时湿度应控制在85％～90%，撕去护膜的幼菇最怕风吹失水，这一阶段要尽力减少温差、湿差，所以早晚通风时风口要随菇体发育再渐渐增大，菌盖长至0.6厘米时即可转入伸长期。③伸长期：通过加大风口和延长通风时间，制造干湿交替环境(75％～90%)，大温差(5℃～20℃)，促使子实体敦实肥厚，以提高单朵重量。
　　在栽培管理过程中，必须注意以下几个要点：
　　(1)拉大温差刺激出菇，控制棚温，谨防捂棚。姬菇是变温结实，只有加大温差才能正常出菇。利用凌晨和午夜气温低时加大通风，造成5℃以上的温差，刺激出菇。力争控制在6℃～12℃或偏低的棚温，这样菌袋温度就能保持在10℃～20℃。降低袋温在头潮管理中非常重要，头潮菇丛密实，阻碍了菌丝体、子实体生长代谢热的散发，越是如此，菇体生长越快，温度上升愈剧烈。此时若恰遇较高的气温和大批次开袋，常致棚温袋温迅速升高以致烧袋死菇即捂棚，捂棚的菌袋菌丝活力丧失不再出菇。冬季天冷棚温过低时，可揭去覆盖物进散射光晒棚升温。
　　(2)湿度恒定稍有变化。姬菇生长时适宜的湿度是85%～90%。湿度的来源是棚内墙体地面蒸发，菇体的蒸腾作用和人工洇水。一般仅在每潮头次菇采收后，因菇体蒸腾作用消失，造成空间低湿度时需大幅加湿，加湿只往地面洇水。加湿要注意温度情况，湿度和温度的关系是，温度高时湿度不可太大，否则，高温蒸腾作用强易产生高湿，导致捂棚和闷棚现象的发生。随着菇体的长大，可针对这部分菇体加大通风，造就75%～90%湿度差，促使子实体敦实肥厚。
　　(3)光照管理。姬菇的发生需要光照刺激，光照强度一般小于40勒克斯，即晴天早晨东方泛起鱼肚白时的强度。温度低时，光强可大至200勒克斯，即晴天阴面室内的光强。进光通过撩揭塑料薄膜上的覆盖物来实现，但要双侧同时进光或单侧交替进行，以防止菇体向光性弯曲。注意刚揭膜的原基，不能有直射光，以免把菇体晒死。
　　(4)通风换气。通风换气是姬菇生长的必要条件，整棚菇体呼出二氧化碳的量是非常大的，若不及时排出，就会形成畸形菇。长时间不通风，二氧化碳浓度过高菇体就会发生二氧化碳中毒死亡，叫闷棚，死菇剔除后还能再转潮。通气的方法就是揭膜通风。
　　通风是温度、湿度、空气调控的总闸门，正是牵一发而动全身，是影响棚内环境稳定均衡的重要措施，在姬菇生产中是一个经常性的工作，核心是利用棚内外温差，缓慢扩散为主，不带来剧烈变化。通风方法是一靠山墙风口常通，二靠前后侧揭膜补充。具体操作上以六看六通为准则，即一看菇多少，菇多多通，菇少少通；二看菇体发育期，伸长期的多通，珊瑚期的少通，刚揭膜的可以不通，与顺次开口相结合，哪一段菇多就通那一段；三看盖柄比例，盖小时多通，柄短时少通；四看棚温，棚温高时长通，棚温低时短通；五看温差，棚内外温差大，冷凝水多时多通，大雾天气长通；六看风向，无风时双侧通，有风时单侧通，不揭迎风口。
　　8.分束采收
　　菇柄长至4厘米长，菌盖直径超过0.8厘米即可采收。从揭膜到采收，最短仅有2天时间。采收时用手掐住一束菇，稍用力往下掰，自一墩菇的下侧逐束采起。分束采收是姬菇最佳的采收方式，姬菇在装袋时采用端放料方式装法，端面菌丝成熟度一致，在料端面紧密排列形成一原基层，各子实体基部既紧密相连又较易分开，当一丛菇体存在生长差异时采大留小，留下的能继续生长，当整个料面的菇体都该采摘时，分束采摘对原基形成层损伤最小，此层面的菌丝又常处于湿润空气的滋润下，能在短时间内形成新菇蕾，所以提倡分束采摘。这样，采菇后的端面菌丝层，只可择去枯死菇，不可搔菌耙掉老菌皮。采后剪去带培养料的菇脚和菌柄，逐根撕开，按级分别放置。
　　9.转潮注水
　　姬菇采用端放料分束采收技术后，料端面菌丝能保持不断分化原基的能力，直至料袋水分枯竭，故在潮次概念上与平菇有所不同，把料袋水分每充盈一次为一个产菇期，称作一潮。姬菇整个产菇期注水2～3次，注水时还可添加营养物质，配方是：尿素0.3%、葡萄糖或白糖0.5%、磷酸二氢钾0.2%、硫酸镁0.1%、石灰0.2%；或1000公斤注水中添加尿素500克、磷酸二铵500克、葡萄糖125克、菇壮素250毫升、三十烷醇25毫升、硫酸镁75克。
　　将配制好的营养液装入大桶内，置于距棚底地面2米以上高处，用塑料软管导入棚内，管端用三通分流成2支水流，每一支装注水器1个。注水时，将注水器尖端自料端面插入，打开开关，让营养渗入菌袋栽培料内，2个注水器轮流使用，注水后的料袋，初始几天要注意加强通风，待注水时渗出的水蒸发、湿度稳定后再减少通风。保养15～20天即可转潮出菇。
　　10.子实体阶段常遇到的问题及解决办法
　　(1)菌丝早已发好，但迟迟不出菇。发生原因：袋温形不成5℃以上温差；菇房相对湿度太低，或不恒定；端面菌皮太厚太硬；害虫危害。
　　解决办法：高温时段出菇的菌袋应稀疏排放，把菌袋放热散发出来；做到早晚气温低时通风，延长通风时间，人为地拉大昼夜温差，促使菌丝扭结，形成原基。菇房相对湿度太低，可采取喷水、洒水等办法提高相对湿度，并使之稳定在85%～95%，保持菇房空气潮湿而又新鲜。菌袋发菌期过长、中间穿孔过大、采用大开口法开袋或催蕾期通风过大均导致两端菌皮太厚太硬阻碍出菇，属于这种情况应直接往料端喷水雾，使料潮湿而不浸水，或者用铁丝制成的小铁耙进行挠菌。害虫危害的菌袋，在端面及菌袋周身能看到筛网或麻脸状的菌皮，一般是跳虫或蚤蝇危害造成的，可用0.1%鱼藤精、除虫菊液直接喷施料面。
　　(2)菇体畸形，状如花椰菜。发生原因：菇房通风条件极不良，二氧化碳浓度在催蕾期过高(>0.25%)。
　　解决办法：改善菇房通风条件，坚持早晚低温时通风，利用棚内外温差，加速二氧化碳扩散。保持山墙两端风口处于常开状态。
　　(3)菇体菌柄或料端面披白毛。发生原因：湿度过大，通风不良。
　　解决办法：菇体菌柄披白毛多见于丛生过密的菇体，料端面披白毛多见于转潮注水后的菌袋，二者发生的条件相似，前者是局部湿度大不通风，后者是整体湿度过大。对于丛生过密的菇体，可以成熟一部分采摘一部分，勿使重叠密不透风透气；料袋注水后，一定要加大通风量，风干地面积水和菌袋沥水，在氧气充足的环境下促使菌丝恢复。
　　(4)菇体异色。有蓝色菇、红色菇、烟熏色菇等。发生原因：蓝色菇是菇体一氧化碳、二氧化硫或二氧化碳中毒；红色菇是袋内温度高，外界水珠刺激菇体，水珠在菇体上变为黄红色而成；烟熏色菇是菇房见了烟，菇盖受烟熏而形成。
　　解决办法：菇房加温时不要用明火加温，用暗火加温，生煤火加温一定要安装煤气管道，并经常通风，把一氧化碳、二氧化硫及二氧化碳排出棚外。拌料时加水量不能太大，已形成袋内积水的及早将水排出，加强通风，勿使菌盖上长期存留水珠。
　　(5)死菇。有干死、晒死，闷死、捂死及染病而死多种。干死、晒死多见于幼菇，其长时间处于风口或直射光下，表现为菇体干涩萎蔫黄变；闷死、捂死多见于伸长期，菇体外观正常，基部着生处松动变软，稍碰触即掉下；染病而死，多见于高温时段出菇的菇棚，菇体变黄，有黏滑感。
　　解决办法：看菇体发育状态通风，做到菇大多通，菇小少通，可分段揭膜，刚揭膜的原基不通，外界有风时不揭迎风口。闷死和捂死，多见于盛菇期，此时菇体代谢旺盛，产出的二氧化碳多、热量大，若1～2天忘记揭膜通风，极易出现二氧化碳中毒死亡和高温烧菌死亡，前者俗称为闷棚，后者称为捂棚。菇体染病的条件是高温高湿，高温时要加强通风降湿，尽量不往菇体上喷重水和不洁净水，杜绝交叉感染，染病的菇体可用抗菌素治疗。